Prof. Eva Schernhammer arbeitet seit dem Jahr 2000 in der Nurses' Health Study-Gruppe, wo sie vor allem in den Harvard-Kohorten, einschließlich der Nurses' Health Studies (NHS) und der Health Professionals Follow-up Study, sowie in einer in Kalifornien durchgeführten Kohortenstudie, der Osteoporotic Fractures in Men (MrOS)-Kohorte älterer Männer, den Einfluss von Nachtschichtarbeit und Schlaf auf chronische Krankheiten und Langlebigkeit beim Menschen untersucht.
Sie verfügt über langjährige Erfahrung mit den drei NHS-Kohorten (NHS, NHS2 und NHS3) und führt ein aktives Forschungsprogramm in der Channing Division of Network Medicine fort. Neben der Krebserkrankung untersucht sie die Auswirkung einer Abweichung des zirkadianen Rhythmus (z.B. Variationen in Genen des zirkadianen und Melatonin-Stoffwechsels, Melatonin-Sekretion, Schichtarbeit, Modifikation der Auswirkungen durch den Chronotyp sowie Schlafdauer, Schlaflosigkeit und andere Schlafparameter) im Zusammenhang mit kardiovaskulären Erkrankungen (z.B. Marker für Entzündungen, Glukose- und Lipidstoffwechsel und Thrombose) und damit verbundenen Endpunkten.
Ein weiterer Forschungsschwerpunkt ist die Untersuchung von Wegen des Energiegleichgewichts einschließlich IGFs im Hinblick auf das Brustkrebsrisiko. Darüber hinaus interessiert sie sich für die Ätiologie und Prävention von gastrointestinalen Tumoren, einschließlich der Frage, wie epigenetische Ereignisse das Darmkrebsrisiko beeinflussen und wie Methylspender mit diesen Ereignissen interagieren. Darüber hinaus untersucht sie Risikofaktoren der Parkinson-Krankheit und war an der Erstellung der weltweit größten bevölkerungsbasierten Fall-Kontroll-Studie zur Untersuchung von GxE bei Parkinson beteiligt.